瞄準國際學科發展前沿，圍繞國家和地方環境領域的重大科技需求，在知識創新、技術引領、解決經濟社會發展中重大環境科技問題等方面取得了一系列标志性成果。近五年來，學院主持國家“973”計劃項目（課題）、國家自然科學基金創新群體項目、傑出青年基金項目、優秀青年基金項目、重點項目、面上項目和國家重大水專項、國家科技支撐計劃等國家及省部級項目100餘項，科研經費約24000餘萬元。依托高層次課題，學院教師的科研能力和學術水平得以持續提高，科研成果顯著。近五年，發表SCI檢索論文510餘篇；申請國家發明專利515項，其中授權242項；出版專著、教材、技術标準等10餘部；形成了一系列具有原創性、突破性和自主知識産權的重大知識創新、技術創新成果，獲得了包括國家科學技術進步一等獎在内的國家及省部級科技獎勵20餘項。