環境科學與工程：1993年和1998年獲得環境工程碩士和博士學位授予權，2000年獲得博士後流動站和環境科學碩士授予權，2003年獲得一級學科博士學位授予權。2017年入選一流學科建設計劃名單。該學科重點在水資源保護理論與水環境修複技術，環境與生态水力學及應用，流域水污染控制和水環境質量改善，固體廢棄物處置與資源化技術，污水處理及廢水回用技術等方面開展基礎理論與應用技術研究。目前已形成以水資源保護與水環境修複等為鮮明特色的學科發展方向，通過學科交叉，凝練出一批具有國内外重要影響和重大應用價值的高水平研究成果，環境生态學ESI排名進入0.3%，已成為在全國環境領域有重要影響的學科。
市政工程：2003年獲碩士和博士學位授予權。該學科緊密圍繞經濟建設和社會發展中水污染控制和供水安全保障等問題，結合國家戰略規劃和學科發展方向，在飲用水安全保障理論與技術、城鎮水系統優化理論與技術、污水處理及資源化利用理論與技術、城市與工業節水理論與技術等方面開展基礎理論與應用技術研究。本學科的特色在于以城鄉水系統良性循環為核心，圍繞水的社會循環中供排水領域的關鍵科學問題和技術難題，并進行多學科高新技術交叉與聯合攻關。通過學科交叉，在城鎮飲用水安全保障理論與技術、污水處理及資源化利用理論與技術等方面産出了一批具有國内重要影響和應用價值的高水平研究成果，已成為在全國市政工程領域有重要影響的學科。
